MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC03

Total Repeats: 541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019895	GGC	2	6	48	53	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
2	NC_019895	CAGC	2	8	114	121	25 %	0 %	25 %	50 %	430748168
3	NC_019895	GCT	2	6	137	142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
4	NC_019895	TCGCT	2	10	202	211	0 %	40 %	20 %	40 %	430748168
5	NC_019895	AGG	2	6	247	252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748168
6	NC_019895	AGC	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
7	NC_019895	GC	3	6	304	309	0 %	0 %	50 %	50 %	430748168
8	NC_019895	GGC	2	6	336	341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
9	NC_019895	CGG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
10	NC_019895	CCG	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
11	NC_019895	TGCG	2	8	577	584	0 %	25 %	50 %	25 %	430748168
12	NC_019895	TTG	2	6	616	621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748168
13	NC_019895	GCC	2	6	694	699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
14	NC_019895	GCT	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
15	NC_019895	AGC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
16	NC_019895	CCG	2	6	938	943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748168
17	NC_019895	TCG	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
18	NC_019895	TTCGGC	2	12	1011	1022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
19	NC_019895	CGG	2	6	1047	1052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
20	NC_019895	CGG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
21	NC_019895	GGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748168
22	NC_019895	GC	3	6	1240	1245	0 %	0 %	50 %	50 %	430748168
23	NC_019895	CGG	2	6	1256	1261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
24	NC_019895	CGA	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748168
25	NC_019895	GCTT	2	8	1295	1302	0 %	50 %	25 %	25 %	430748168
26	NC_019895	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
27	NC_019895	TCC	2	6	1360	1365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748168
28	NC_019895	CGGTGA	2	12	1403	1414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430748168
29	NC_019895	GGC	2	6	1473	1478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
30	NC_019895	GCT	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
31	NC_019895	TCG	2	6	1588	1593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
32	NC_019895	CCA	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748168
33	NC_019895	AACTC	2	10	1631	1640	40 %	20 %	0 %	40 %	430748168
34	NC_019895	CTT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
35	NC_019895	GCG	2	6	1723	1728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
36	NC_019895	CGG	2	6	1732	1737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
37	NC_019895	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
38	NC_019895	GTC	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748168
39	NC_019895	CGG	3	9	1838	1846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748168
40	NC_019895	CTT	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748168
41	NC_019895	ATC	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748168
42	NC_019895	TAT	2	6	1898	1903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748168
43	NC_019895	TCC	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748169
44	NC_019895	GGT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748169
45	NC_019895	TGA	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748169
46	NC_019895	GCC	2	6	2039	2044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748169
47	NC_019895	ACA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748169
48	NC_019895	GGC	2	6	2143	2148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748169
49	NC_019895	CTG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748169
50	NC_019895	TGG	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748169
51	NC_019895	CGC	2	6	2346	2351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748170
52	NC_019895	AGC	2	6	2429	2434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748170
53	NC_019895	GTC	2	6	2452	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748170
54	NC_019895	TTCC	2	8	2476	2483	0 %	50 %	0 %	50 %	430748170
55	NC_019895	TCG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748170
56	NC_019895	CTTG	2	8	2496	2503	0 %	50 %	25 %	25 %	430748170
57	NC_019895	GCTGC	2	10	2506	2515	0 %	20 %	40 %	40 %	430748170
58	NC_019895	TGG	2	6	2562	2567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748170
59	NC_019895	TG	3	6	2592	2597	0 %	50 %	50 %	0 %	430748170
60	NC_019895	CCG	2	6	3249	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748171
61	NC_019895	AAC	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748171
62	NC_019895	TCC	2	6	3390	3395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748171
63	NC_019895	CAT	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
64	NC_019895	GTA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
65	NC_019895	AGCCC	2	10	3490	3499	20 %	0 %	20 %	60 %	430748171
66	NC_019895	CTG	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748171
67	NC_019895	ATT	2	6	3631	3636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748171
68	NC_019895	CA	3	6	3687	3692	50 %	0 %	0 %	50 %	430748171
69	NC_019895	CCTG	2	8	3694	3701	0 %	25 %	25 %	50 %	430748171
70	NC_019895	CCG	2	6	3710	3715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748171
71	NC_019895	TCA	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
72	NC_019895	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748171
73	NC_019895	GCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748171
74	NC_019895	CCCG	2	8	4020	4027	0 %	0 %	25 %	75 %	430748171
75	NC_019895	ATG	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
76	NC_019895	GAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748171
77	NC_019895	CGG	2	6	4102	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748171
78	NC_019895	CAC	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748172
79	NC_019895	GC	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	430748172
80	NC_019895	AAG	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748172
81	NC_019895	GCC	2	6	4702	4707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
82	NC_019895	CAC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748172
83	NC_019895	GTGAGG	2	12	4743	4754	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	430748172
84	NC_019895	GCC	2	6	4793	4798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
85	NC_019895	CTC	2	6	4805	4810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748172
86	NC_019895	CGG	2	6	4815	4820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
87	NC_019895	CCG	2	6	4859	4864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
88	NC_019895	CGG	2	6	4885	4890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
89	NC_019895	CCGC	2	8	4891	4898	0 %	0 %	25 %	75 %	430748172
90	NC_019895	CGAT	2	8	4956	4963	25 %	25 %	25 %	25 %	430748172
91	NC_019895	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
92	NC_019895	GAA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748172
93	NC_019895	TGC	2	6	5121	5126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
94	NC_019895	GGC	2	6	5177	5182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748172
95	NC_019895	GGA	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748172
96	NC_019895	GCA	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748172
97	NC_019895	ATC	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748172
98	NC_019895	CGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748172
99	NC_019895	GCT	2	6	5674	5679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748172
100	NC_019895	GAA	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748173
101	NC_019895	GCC	2	6	5920	5925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748173
102	NC_019895	CGA	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748173
103	NC_019895	CCGGG	2	10	6018	6027	0 %	0 %	60 %	40 %	430748173
104	NC_019895	CTGC	2	8	6054	6061	0 %	25 %	25 %	50 %	430748173
105	NC_019895	TGG	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748173
106	NC_019895	GCT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748173
107	NC_019895	GCC	2	6	6122	6127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748173
108	NC_019895	GCT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748173
109	NC_019895	GGC	2	6	6292	6297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
110	NC_019895	GCTGGC	2	12	6360	6371	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	430748173
111	NC_019895	CGG	2	6	6377	6382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
112	NC_019895	CGG	2	6	6480	6485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
113	NC_019895	CGG	2	6	6503	6508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
114	NC_019895	GAC	2	6	6526	6531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748173
115	NC_019895	AGG	2	6	6560	6565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748173
116	NC_019895	GGC	2	6	6583	6588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748173
117	NC_019895	CGT	2	6	6623	6628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748173
118	NC_019895	GGTT	2	8	6706	6713	0 %	50 %	50 %	0 %	430748174
119	NC_019895	CGT	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748174
120	NC_019895	TGCCC	2	10	6777	6786	0 %	20 %	20 %	60 %	430748174
121	NC_019895	CTG	2	6	6790	6795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748174
122	NC_019895	GCC	2	6	6799	6804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748174
123	NC_019895	CCG	2	6	6805	6810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748174
124	NC_019895	ACC	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748174
125	NC_019895	CCGC	2	8	6826	6833	0 %	0 %	25 %	75 %	430748174
126	NC_019895	AAG	2	6	6841	6846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748174
127	NC_019895	CGC	2	6	6993	6998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748174
128	NC_019895	GCA	2	6	7082	7087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
129	NC_019895	CGA	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
130	NC_019895	CGA	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
131	NC_019895	CGTG	2	8	7203	7210	0 %	25 %	50 %	25 %	430748174
132	NC_019895	CGA	2	6	7254	7259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
133	NC_019895	GCA	2	6	7369	7374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748174
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135	NC_019895	GTG	2	6	7513	7518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748174
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261	NC_019895	CCG	2	6	12968	12973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748181
262	NC_019895	CGT	2	6	13060	13065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748181
263	NC_019895	CGG	2	6	13068	13073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748181
264	NC_019895	TTGGCC	2	12	13079	13090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748181
265	NC_019895	CGA	2	6	13128	13133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748181
266	NC_019895	GGA	2	6	13162	13167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748181
267	NC_019895	GCGTGA	2	12	13170	13181	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430748181
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270	NC_019895	C	6	6	13311	13316	0 %	0 %	0 %	100 %	430748181
271	NC_019895	GCG	2	6	13346	13351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748181
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273	NC_019895	CCT	2	6	13373	13378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748181
274	NC_019895	ACT	2	6	13542	13547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748182
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277	NC_019895	AAG	2	6	13662	13667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748182
278	NC_019895	CGGA	3	12	13706	13717	25 %	0 %	50 %	25 %	430748182
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280	NC_019895	ACC	2	6	13770	13775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748182
281	NC_019895	CGC	2	6	13839	13844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748182
282	NC_019895	CAGGG	2	10	13901	13910	20 %	0 %	60 %	20 %	430748182
283	NC_019895	GGGC	2	8	14721	14728	0 %	0 %	75 %	25 %	430748183
284	NC_019895	CGG	2	6	14736	14741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748183
285	NC_019895	CGG	3	9	14783	14791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748183
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289	NC_019895	CGG	2	6	14943	14948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748183
290	NC_019895	CTG	2	6	14962	14967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748183
291	NC_019895	GGC	2	6	14973	14978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748183
292	NC_019895	TCTT	2	8	15002	15009	0 %	75 %	0 %	25 %	430748183
293	NC_019895	CTT	3	9	15007	15015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748183
294	NC_019895	CGC	2	6	15026	15031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748183
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300	NC_019895	GCC	2	6	15316	15321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748183
301	NC_019895	TTG	2	6	15326	15331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748183
302	NC_019895	CGGGC	2	10	15358	15367	0 %	0 %	60 %	40 %	430748183
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382	NC_019895	CCGG	2	8	21182	21189	0 %	0 %	50 %	50 %	430748189
383	NC_019895	GGC	2	6	25406	25411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748191
384	NC_019895	GCA	2	6	25456	25461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748191
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386	NC_019895	GATC	2	8	25511	25518	25 %	25 %	25 %	25 %	430748191
387	NC_019895	TGC	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748191
388	NC_019895	GGC	2	6	25545	25550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748191
389	NC_019895	GCT	2	6	25557	25562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748191
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392	NC_019895	GGC	2	6	25625	25630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748192
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497	NC_019895	GCC	2	6	30442	30447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748195
498	NC_019895	AACAGG	2	12	30471	30482	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	430748195
499	NC_019895	GAT	2	6	30498	30503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748195
500	NC_019895	CGG	2	6	30506	30511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748196

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